Förväntad tid till fixering under mutation, drift och selektion Lars Larsson 25 maj 2009 Drivkraften för evolutionen är mutationer. En mutation innebär en förändring av en gen. Detta kan ske naturligt när DNA:t kopieras vid celldelning eller genom någon yttre påverkan som t.ex. röntgenstrålning som kan slå sönder DNA:t. Genom att modellera hur reproduktionen hos en population fungerar kan man studera hur mutationer förändrar populationers genom. Wright-Fishers modell, är en ganska enkel sådan reproduktionsmodell. Den är uppkallad efter Sewall Wright och Sir Ronald A. Fisher som under 20- och 30-talet var med och lade grunden för den matematiska teorin bakom populationsgenitiken. Deras modell kan användas för att uppskatta sannolikheten att en mutation fixeras, vilket betyder att endast den typ av genen som mutationen resulterat i av finns kvar i populationen. För att få en tidsanknytning till evolutionen kan det vara särskilt intressant att uppskatta fixeringstiden, alltså hur lång tid det förväntas ta att uppnå fixering. I tabell 1 ses fixeringstiden mätt i antal generationer för populationer med N stycken individer. N 5 50 500 5000 5 · 104 5 · 105 5 · 106 5 · 107 h=0 187900 120200 40200 13800 6800 5800 5800 620 s = 0, 02 h = 0, 5 183200 88000 10900 2200 1600 1800 1300 1200 h=1 178700 67000 6200 3000 6800 20000 59200 168000 h=0 151700 56700 18000 6100 3000 2400 120 120 s = 0, 1 h = 0, 5 134700 21600 2300 520 400 230 240 240 h=1 120900 12300 1500 1200 3000 8900 27200 81700 Tabell 1: Antal generationer till fixering. Hur lång fixeringstiden förväntas bli beror på flera olika faktorer. Om någon typ av en gen gynnar individen så att den överlever lättare är sannolikheten större att just den typen av genen lever vidare. Detta styrs i modellen av en selektionsfaktor s. Då s är positiv gynnar resultatet av mutationen individen mer än vad ursprungsgenen gör. Är s negativ är ursprungsgenen bättre. Vid en jämförelse av höger- och vänstersidan i tabell 1 ser vi hur selektionsfaktorn påverkar fixeringstiden. Det är uppenbart att ett större s ger en lägre fixeringstid, men det ser inte ut att påverka så extremt mycket. Individen har två uppsättningar av varje gen en från mamma och en från pappa. En individ med två lika gener, två ursprungsgener, eller två muterade gener kallas homozygot. En individ med en av varje kallas hetrozygot. Dominansgraden h anger hur mycket hetrozygoten påverkas av den muterade genen. Är h = 0, 5 påverkas hetrozygoten lika mycket av båda typerna av genen. Är h = 0 påverkas hetrozygoten endast av ursprungsgenen. Är h = 0 krävs det alltså betydligt fler muterade gener inom populationen innan några individer kommer att gynnas av dem. Detta är anledningen till den sjunkande fixeringstiden. Ju större populationen är desto fler mutationer sker och fler individer kommer att gynnas. Antalet mutationer per celldelning är här satt till 5 · 10−6 . Är h = 1 påverkas hetrozygoten endast av den muterade genen. Den gynnas alltså lika mycket som en individ med två muterade gener. Detta borde alltså leda till en lägre fixeringstid eftersom att fler individer gynnas snabbare. För mindre populationer ser det ut som att det förhåller sig på det viset, dock inte för större populationer. Här får vi istället se en motsatt effekt. Detta beror just på att det ska till två ursprungsgener för att en individ ska bli missgynnad. Om det finns ett mindre antal hetrozygoter i en större population är sannolikheten inte särskillt stor att två av dem bildar ett par och lyckas få en homozygot avkomma. Det kommer alltså att vara svårt att bli av med de sista ursprungsgenerna. Detta är anledningen till att vi har ovanliga sjukdomsgener som aldrig försvunnit. Det är dessa gener som utgör en akut fara vid inavel. I vanliga fall är det mycket ovanligt att två föräldrar ska bära på samma sjukdomsgen. Är däremot föräldrarna nära släkt med varandra ökar risken markant.