Karakterisering av ett protein hos Trypanosoma cruzi som kan vara inblandat i
reglering av genuttryck
Anna-Maja Nyström
I Sydamerika lider ca 18 miljoner av Chagas sjukdom som orsakas av parasiten
Trypanosoma cruzi och kan leda till döden i 10-30% av fallen. I dag finns inga
vacciner eller säkra läkemedel mot sjukdomen. Döden tros orsakas av att parasiten
slår ut nervsystemet i vissa delar av kroppen, framför allt i hjärtat och magtarmkanalen. Parasiten är inte bara medicinskt intressant utan utgör även en modell
där många unika biologiska processer kan studeras. Världshälsoorganisationen
(WHO) har startat ett projekt som syftar till att sekvensera trypanosomens hela
genom, för att om möjligt hitta gener som är livsviktiga för parasiten men som skiljer
sig mycket från människans gener. Dessa gener och deras produkter skulle då kunna
användas som nya måltavlor för tillverkning av vaccin och läkemedel.
DNA kan sägas vara en kedja uppbyggd av fyra byggstenar, eller baser, som kallas A,
T, G och C. Gener utgör bitar av den här kedjan med specifika kombinationer av
baserna. Gener kan översättas till proteiner som är de molekyler som utför olika
funktioner i cellen. Denna översättning görs via en kopia av genen som kallas mRNA.
Om man identifierar alla gener som uttrycks som mRNA i en organism får man
snabbt reda på vilka bitar av DNAt som översätts till protein, eftersom en stor del av
arvsmassan inte används. I en studie vid Institutionen för Genetik & Patologi vid
Uppsala Universitet hittade man en del av ett mRNA som man antog bildar ett protein
som binder till RNA-sekvenser rika på pyrimidin (byggstenarna C och T). I andra
organismer har liknande protein, kallade PTB, visat sig delta i regleringen av
översättningsprocessen genom att binda till pyrimidinrika sekvenser i mRNA.
Trypanosomproteinet skulle kunna vara en måltavla för läkemedel eftersom parasitens
översättningsmekanism skiljer sig från människans och en sådan process är
livsnödvändig för parasiten. För att kunna undersöka detta måste man först
karakterisera hela genen och läsa av DNA-sekvensen som hör
till det här proteinet. I detta projekt har jagsekvensbestämt
Cellkärna
70% av hela genen och hittat tre speciellt viktiga områden
DNA:
som har betydelse för det färdiga proteinets funktion.
gen
Genen kommer sedan att sättas in i en bakterie som
kan producera större mängderav detta protein.
mRNA
protein
Examensarbete i biologi, 20 p, VT 2000
Institutionen för Genetik & Patologi, Uppsala Universitet
Handledare: Lena Åslund
PTB
