Tentamen för BIMA12 – Cellbiologi, 2014-02-07 Proteiner Fråga 1. a.) Rita tripeptiden Lys-Pro-Asp vid pH 7. Markera N- och C- terminal, en av peptidbindningarna, samt laddningar. (2 p) b) Rita ut laddningarna vid pH 3. (1 p) Fråga 2. Na+/K+ pumpen är en av de viktigaste jonpumparna i kroppen. Förklara hur den fungerar med hjälp av nedanstående figur och de kunskaper du har om proteiners veckning och affinitet för olika substrat. (3 p) Fråga 3. a.) Vid en laboration analyserar du en upprening av proteinet Immunoglobulin G med SDS-PAGE. Proteinet är totalt c:a150 kDa stort (molvikt på 150.000 g/mol) och består av två tunga kedjor (50 kDa) och två lätta kedjor (25 kDa) som sitter ihop med S-S-bryggor. Du bestämmer dig för att köra två SDS-PAGE geler: 1. du reducerar provet (med DTT) och 2. du kör oreducerade prover. Vilka storlekar på band på de två gelerna förväntar du dig att hitta? (1 p) b.) Du kör sedan ytterligare två identiska geler varav den ena färgas in (med t.ex. EZBlue Gel Staining Reagent) och den andra används till en western-blott. Vad är skillnaden mellan informationen som erhålls från de båda analyserna? Varför utförs båda analyserna? (2 p) Fråga 4. Beskriv hur ett transmembranprotein, med en enkel passage genom membranet, som så småningom ska sitta i plasmamembranet bildas. Börja med mRNA i cytosolen och beskriv stegvis vad som händer tills det är färdigtranslaterat. I svaret bör följande ord ingå, men inte begränsas av: ribosom, signalpeptid, translokator, ER. Rita gärna! (3 p) Cellens strukturer Fråga 5. Vad är exocytos? (1 p) Beskriv processen när en vesikel bildas, varför den bildade vesikeln flyttar sig åt ett visst håll och hur den hittar sitt mål! (2 p) 1 Fråga 6. Redogör för cellkärnan: a,) Beskriv hur det omgivande ”nuclear envelope” (som lite missvisande brukar kallas ”kärnmembranet” på svenska) är uppbyggt! (1 p) b.) Hur kan transport av proteiner från kärn-utrymmet till cytosolen ske genom strukturen? (1 p) c.) Vad är cellkärnans huvudsakliga funktion? (1 p) Fråga 7. Beskriv uppbyggnaden av mikrotubuli! a.) Vilka beståndsdelar bygger upp den? (1 p) b.) Vilken egenskap hos strukturen gör att mikrotubuli-filament kan fungera vid rörelse? (1 p) c.) Ge ett exempel på rörelse i cellen som är beroende av mikrotubuli! (1 p) DNA Fråga 8. a.) Vad är en mutation? (1 p) b.) Vilka olika typer av mutationer finns? (1p) c.) Ge ett exempel på hur en mutation uppkommer, molekylärt! (3 p) Fråga 9. Rita en kort del av en mRNA-sträng, när den översätts till aminosyran metionin vid translations-processen. Ange namnen på kvävebaserna, och rita bindningarna mellan mRNA:ts byggstenar i detalj. Glöm inte att ange 5’ och 3’-ändar. Nämn också vad adaptormolekylerna heter, som leder till att just aminosyran metionin inkorporeras här. (3 p) Fråga 10. a.) Hur många kromosomer finns det i en hjärncell hos människa? (1 p) b.) Rita en av dessa (t ex kromosom 1) schematiskt! Ange namn på kromosmens centrala och änd-delar. Markera p-arm och q-arm. (1 p) c.) Vad heter fasen i cellcykeln när kromosomen replikeras? Vad heter fasen när de två kromosomkopiorna som är resultatet av replikationen separerar från varandra för att vandra mot det som ska bli två nya cellkärnor? (1 p) Fråga 11. Redogör för RNA: a.) Vilka olika typer av RNA finns i cellen (ange minst fyra olika!)? (1 p) b.) Vilket RNA finns det mest av i cellen? (0,5 p) 2 c.) Beskriv en (valfri) typ av RNA – Var den bildas, med vilken process den bildas, ungefär hur stor molekylen är och om den modifieras innan den har sin biologiska funktion! (1,5 p) 3 Fråga 12. Beskriv schematiskt hur DNA-syntesen går till vid replikationen av genomiskt DNA, som den sker normalt i cellcykeln innan en cell ska dela sig! Ange var processen börjar och slutar på en viss kromosom och ge detaljer om de proteiner och andra molekyler som är inblandade i replikationen! Vad är en ”replication fork”? (3 p) 4 Metabolism Fråga 13. Beskriv kortfattat varför FADH2 ger mindre energi (ATP) än NADH vid oxidativ fosforylering. (3 p) 5 Fråga 14. Acetyl-CoA är en central intermediär i metabolismen. Beskriv tre sätt varvid acetylCoA förbrukas. (3 p) 6 Fråga 15. Glykolys avstannar om inte NAD+ finns tillgängligt som kofaktor när glyceraldehyd3-fosfat omvandlas till 1,3-bisfosfoglycerat. Beskriv kortfattat 3 sätt varpå cellulär metabolism kan generera NAD+ för detta ändamål. (3 p) 7 Fråga 16. a.) Vilka två protein utgör ß-cellens ”glukossensor”, dvs vilka två protein gör att ßcellens metabolism reagerar dosberoende på blodglukosnivån? (2 p) b.) Vilken egenskap hos dessa protein ger dem sensoregenskaper? (1 p) 8 Fortsättning på fråga:_______________ 9 Fortsättning på fråga:_______________ 10 Fortsättning på fråga:_______________ 11 Fortsättning på fråga:_______________ 12 Fortsättning på fråga:_______________ 13 Fortsättning på fråga:_______________ 14