Aminosyror — — — — — — H2C – O CH 2 CH 2 NH — — O — — — — + H3N — C — C – O CH 2 — CH2 — — — — — — — + H3N — C — C – O — CH 2 H O — — + H3N — C — C – O CH 2 CH3 Isoleucin (Ile)(I) Leucin (Leu)(L) H O — — — H — — — — + H3N — C — C Valin (Val)(V) Alanin (Ala)(A) O — — H — — CH2 CH CH3 CH3 Glycin (Gly)(G) – O H3C—CH — CH3 CH3 O — — — + H3N — C — C – O CH2 — H O — — + H3N — C — C – O CH Opolära sidokedjor Ip mellan pH 5,8 - 6,3 — — — — — — — CH3 H O — — + H3N — C — C – O — H H O — — — — + H3N — C — C – O — — H O — — H + H3N — C — C — Aminosyror och proteiner S CH3 H O CH 2 CH2 + NH3 Asparaginsyra (Asp)(D) Ip = 3,0 Aminosyror q , q q q ³ q ÊÊ Ó ÊqÊ ÊqÊ "" , q ÊÊ Î ÊqÊ ÊqÊ ""ÊÊÊÊÊr ÊÊ Ó ÊqÊ ÊqÊ "" «> Ó ÃiiÌÀÃ>Ê«ÕÌi «ÊrÊ«ÊrÊ>``>` «ÊÊ«ÊrÊ«ÃÌÛ «ÊÊ«ÊrÊi}>ÌÛ ³ q , ³ q , ³ q ÊÊ Î ÊqÊ ÊqÊ ""ÊÊÊr ÊÊ Î ÊqÊ ÊqÊ "" ÊÊ Î ÊqÊ ÊqÊ "" peptid <10 polypeptid >10 protein >50 q , q ÊÊ Î ÊqÊ ÊqÊ "" q «> £ , ³ Lysin (Lys)(K) Ip = 9,1 ÌÃ>ÌÌÊ" — — — — O — — — + – H3N — C — C CH 2 NH – O — O CH2 + NH CH 2 + C = NH 2 NH2 Arginin (Arg)(R) Ip = 10,8 Peptidbindning « , Glutaminsyra (Glu)(E) Ip = 3,1 — — — — C — CH2 — O CH 2 H O H3N — C — C — — – + – O C — NH 2 O Glutamin (Gln)(Q) — O — — — — CH2 CH 2 H O H3N — C — C — — — — — — + – O — — — — — CH2 CH2 — — O D-aminosyra H O H3N — C — C Asparagin (Asn)(N) — — – L-aminosyra + – O Tyrosin (Tyr)(Y) — — CH2 C — H O — — + H3N — C — C — — H Elektriskt laddade sidokedjor Cystein (Cys)(C) — — Treonin (Thr)(T) – O CH2 — — OH Serin (Ser)(S) H3N — C — C — — C — NH 2 O O — CH2 + – O — — — — H3N — C — C – O — SH — — + O — — — — CH 2 H O H3N — C — C – O — — — — CH 2 OH CH3 OH — — — — — — — CH + — — H3N — C — C – O Prolin (Pro)(P) Tryptofan (Trp)(W) H O — — + — — CH3 H3N — C — C – O H O — — H3N — C — C + — Ip mellan pH 5,0 - 5,7 + — — Polära sidokedjor Fenylalanin (Phe)(F) H O — — H — Metionin (Met)(M) Histidin (His)(H) Ip = 7,7 Proteiner Primär struktur &ÛiÀÃÌÊÛiÀÊ«ÀÌiiÀ>ÃÊvÕÌ £ä ££ /Þ«Ê>ÛÊ«ÀÌi ÕÌ Ýi«i -ÌÀÕÌÕÀ«ÀÌiiÀ -Ì` ÃiÌiÀÊV Êë`>ÀÊ>ÛB`iÀÊÃiÃvLÀiÀÊvÀÊ>ÌÌÊLÞ}}>Ê}iÀÊÀiëiÌÛiÊBÌ° >}iÊV Êi>ÃÌÊ}iÀÊÃÌ`ÊÊ`ÕÀiÃÊÛBÛ>`iÀ°ÊiÀ>ÌÊBÀÊ`iÌÊÕ««LÞ}}>`iÊ«ÀÌiiÌÊÊ FÀ]Ê À]ÊvB`À>ÀÊV Ê>`À>ÊÕÌÃÌÌÊvÀFÊ Õ`i° "Û>LÕÊBÀÊ«ÀÌiiÌÊÊB}}ÛÌ>]ÊV Ê>ÛB`ÃÊÃÊB>ÊvÀÊ>ÃÞÀÀÊÛ`Ê Õ««LÞ}}>`iÊ>ÛÊiLÀÞÌ°Ê>ÃiÊ >ÀÊÌÃÛ>À>`iÊvÕÌÊÊ°Ê6BÝÌiÀ >ÀÊ>Ê>}À}ëÀÌiiÀÊÊÃ>ÊvÀ° >}À}ëÀÌiiÀ ÀÛ>À}Ê>ÛÊ >ÃÞÀÀ /À>ëÀÌ«ÀÌiiÀ /À>ëÀÌÊ>ÛÊ>`À>Ê ÃÕLÃÌ>ÃiÀ i}LÊÌÀ>ëÀÌiÀ>ÀÊÃÞÀiÊÊL`iÌ°Ê`À>ÊÌÀ>ëÀÌ«ÀÌiiÀÊÌÀ>ëÀÌiÀ>ÀÊÞÞiÀÊ }iÊViiLÀ>° ,i}Õ>ÌÀÃ> ❖ «ÀÌiiÀ ­ ÀiÀ® À`>ÌÊ>ÛÊ ÃÕÊÀi}iÀ>ÀÊÃViÀ >ÌiÊÊÀÞ}}À>`Ã`ÕÀiÃÊL` ,iVi«ÌÀiÀ iiÃÊÃÛ>ÀÊ«FÊ iÃÊÃÌÕ ,iVi«ÌÀiÀÊÊiÀÛViiÃÊiLÀ>ÊÀi>}iÀ>ÀÊ«FÊiÃ>ÊÃ}>iÀÊvÀFÊ>`À>ÊiÀÛViiÀ ->>`À>}>`iÊ «ÀÌiiÀ ,ÀiÃi ÌÊV ÊÞÃÊÃÛ>À>ÀÊvÀÊÃ>>`À}}iÊÊÕÃiÀ>°Ê`À>Ê«ÀÌiiÀ}iÀÊÀÀiÃiÀÊÊ ViÀÊV Êv>}iiÀ° ÀÃÛ>ÀëÀÌiiÀ -Þ``ÊÌÊ ÃÕ`>À ÌÀ««>ÀÊvÀÃÛ>À>ÀÊÃÃÊÌÊL>ÌiÀiÀÊV ÊÛÀÕà âÞiÀ -iiÌÛÊvÀ }Ê>ÛÊ >ÃÌ} iÌiÊvÀÊ iÃ>ÊÀi>ÌiÀ âÞiÀÊÊiÌ>LÃiÊ>Ì>ÞÃiÀ>ÀÊ Þ`ÀÞÃiÊ>ÛÊ`iÊ«ÞiÀiÀÊÃÊ>ÌiÊLiÃÌFÀÊ>Û 6> -iÀ * i 6> > n à Þà /ÞÀ iÕ Þà Îä Õ > Ã Õ 6> i -iÀ à 6> à Þà 6> /ÞÀ Þ Õ À} Þ * i iÕ iÕ £ä Îä Õ>ÌÊÃÕÊ / ÀÊ -iÀÊ iÊ / À *ÀVÌÊÃÕÊ / ÀÊ -iÀÊ iÊ > ÛÌÊÃÕÊ >Ê > / À £ > iÕ n *À Óä ÞÃ Õ Þ Þà /ÞÀ Þ È ÞÃ Ç Ã iÕ £ ÞÃ Ç iÕ -iÀ * i -iÀÊ 6>Ê /ÞÀ À}>ÃiÃÊ uppgifter Proteinernas >ÌÛÌiÌ £ä 6> Sekundär struktur ❖ à iÕ / À *À Õ Õ Þà À>>ÊÀ`>ÊL`À««>ÀÊV Ê«ÀBÀ ÃÌÀÕÌÕÀiÊ ÃÊÀ>ÌÊ i}L Vätebindningar mellan närliggande peptidbindningar ger regelbundet mönster à iÕ / À *À Tertiär struktur ❖ Protein Vätebindningar α-struktur 6> β-struktur Veckning till en bestämd tredimensionell form 6> Õ Þà -ViViÊL`À««>ÀÊV Ê«ÀBÀ ÃÌÀÕÌÕÀiÊ ÃÊÃViViÊ i}L Kvartär struktur Flera polypeptinkedjor bygger upp proteinet – ofta med en eller flera prostetiska grupper ÛL`>ÊÀ}iÃÌÀF>À -ÌÀF}à B> Hemoglobin ,Ì}iÃÌÀFi ÀÃÌ> b-struktur Ì}À>vÃÊv Ê,Ì}iÀÃÌ>}À>v Polypeptidkedjor Järnatom Hemgrupp a-struktur ÊiÌÀ`iÃÌiÌÃ>ÀÌ> Kollagen Sekvensbestämning Ê,Ì}iL`Ê>ÛÊ«ÀÌiÀÃÌ>i Ê>ÌÀ`iÊ>ÛÊ«ÀÌiiÌÊÀLÕVi>ÃiÊ­>®Ê ÊÊÊÊÊLÕ`iÊÌÊiÊ>ÃÞÀ>i`>Ê­}À® Sammanfattning «}Û Ìvà ëÞvÕ}> ÃiÃ>Ã Ê nÊ ÈÊ {Ê £ÎÊ £ÓÊ ££Ê Ê £ÎÊ £{Ê £ÓÊ £xÊ £ÓÊ ÓÓÊ £äÊ ÓäÊ £xÊ £nÊ £{Ê £ÇÊ ££Ê £{Ê Ê ££Ê Ó£Ê Ó£Ê £Ê £ÇÊ ÓÇÊ ÓÈÊ ÓÓÊ ÓÓÊ Î£Ê {ÎÊ {nÊ ÎäÊ {ÎÊ {ÇÊ ÓÊ {ÈÊ {ÈÊ ÓÇÊ {xÊ {ÈÊ {x {xÊ {È {x BÃÌ vFÀ Õ` > ÊÊ ÊÊ ÊÊ ÊÊ ÊÊ ÊÊ ÊÊ ÊÊ ÊÊ ÊÊ ÊÊ ÊÊ ÊÊ Ê Ê Ê Ê Ê Ê Ê Ê Ê Ê Ê Ê Ê Ê Ê Ê Ê Ê Ê Ê Ê Ê Ê Ê Ê Ê Ê Ê Ê Ê Ê Ê Ê Ê Ê Ê Ê Ê Ê xÊ Ê Ê Ê Ê Ê Ê Ê Ê Ê Ê Ê Ê £äÊ nÊ Ê Ê Ê Ê Ê Ê Ê Ê Ê Ê Ê £äÊ nÊ ÓÊ Ê Ê Ê Ê Ê Ê Ê Ê Ê Ê Ê £ÓÊ Ê ££Ê nÊ ££Ê nÊ £ÓÊ ÓÓÊ Ó{Ê Ê £äÊ Ê Ê Ê Ê Ê Ê Ê Ê Ê Ê Ê Ê £nÊ £ÇÊ £ÇÊ £nÊ ÓÈÊ £nÊ £xÊ Ê Ê Ê Ê Ê Ó£Ê Ó£Ê ÓÎÊ Ó{Ê ÓÊ Ó{Ê ÓÓÊ Ó{Ê Ê Ê Ê Ê ÓxÊ ÓÈÊ ÓnÊ ÓÇÊ Î£Ê ÓnÊ ÓÊ ÎÓÊ £{Ê Ê Ê Ê {x {x {È {x {Ç { {Ç {Ç {xÊ {Ç {Ç {£Ê > «}Û Ã>iÀÀ Ã`«>``> Ý}À`> Ìvà ëÞvÕ}> ÃiÃ>à ÛiÌi LÀ`}i Ó£Ê £nÊ £Ê ÓäÊ Ê Ê Ê Ê Ê Ê Ê Ê {{Ê {{Ê {ÈÊ {ÈÊ {ÈÊ {ÈÊ {nÊ {Ê {xÊ {xÊ Ê Ê {ÈÊ {ÈÊ {ÇÊ {nÊ {ÇÊ {Ê {Ê {nÊ {£Ê {ÇÊ x{Ê Ê L>}iÀBÃÌ > ££Ê £äÊ ÈÊ ÎÊ LÀ`}i > £äÊ Ê ÎÊ Ê ÛiÌi Õ` £ÓÊ ££Ê Ê Ê Ý}À`> vFÀ ÊÊ £ ÊÊ ÊÊ ÊÊ Ã>iÀÀ BÃÌ BÃ> >«> Ã`«>``> ->`iÀÊÊ>ÃÞÀ>ÃiÛiÃiÊvÀÊVÞÌÀÊV >«> ❖ Strukturbestämning ❖ Vi har nu gått igenom de viktigaste begreppen för aminosyror och proteiner: ❖ ❖ ❖ ❖ ❖ ❖ ❖ ❖ ❖ Aminosyra Isoelektrisk punkt Peptidbindning Proteinernas funktion Primär stuktur Sekundär struktur Tertiär struktur Kvartär struktur Bestämning av proteinernas struktur och sekvens