Övning 2 1. Rita en aminosyra! Vilka funktionella grupper innehåller den? 2. Alanin och valin kan reagera med varandra och bilda två olika dipeptider. Skriv formlerna för båda reaktionerna. Ralanin=CH3, Rvalin=CH(CH3)2 Vilken typ av reaktion är det? 3. Glukos är en reducerande sockerart. Vilken funktionell grupp i glukosmolekylen oxideras? Vad oxideras den till, tror du? Jfr lab 2, gelfiltrering 4. Numrera kolatomer i en schematisk glukosmolekyl från 1-6? 5. Man låter en blandning av aminosyror, peptider och proteiner passera genom en gelfiltreringskolonn. I vilken ordning kommer ämnena ut? Motivera! (Tillämpning på laboration 2). 6. Beskriv den sekundära strukturen hos silke! Hur stabiliseras denna struktur? Bindningstyp? Se kursboken sidan 269, upplaga 3 (241, upplaga 2) om β-struktur, särskilt figur 12.14 (12.11) 7. Vilka uppgifter har proteinerna i kroppen? 8. En tripeptid har aminosyrasekvensen Ala-Tyr-Lys. Vilken aminosyra är N-terminal? Skriv den fullständiga strukturformeln för tripeptiden. R(Ala)=CH3, R(Tyr)=CH2PhOH, R(Lys)= CH2CH2CH2CH2NH2) Se sidan 259 (217). 9. Beskriv kort vad ämnesomsättning innebär. 10. Vad bildas när magsaft och bukspott inverkar på proteiner? Se figur 11.3 (13.3) 11. Vad sker i glykolysen och var sker reaktionerna? Inga detaljer, det räcker med slutprodukten 12. Vad är ATP? Varför är föreningen energirik? Se sidan 228 (256). 13. Skriv strukturformeln för pyruvatjonen och acetylgruppen. Se kapitlet om ämnesomsättningen. 14. Hur ser de aminosyror som inte kan bildas i kroppen ut? Se sidan 245 (272) sista stycket och tabell 10.1 (11.1) 15. De katabola och anabola reaktionerna kan inte ske samtidigt i cellen och de sker dessutom på olika ställen i cellen. Var sker dessa reaktioner? Hur styrs reaktionerna? Se under anabolismen i kap 11 (13). 16. Kolhydraternas nedbrytning kan indelas i tre steg. Vilka? 17. Hur lagras energi i vår kropp? Se sidan 242 (268). 18. Vid nedbrytning av fettsyror bildas samma molekyl som vid nedbrytning av glukos. Hur många kol innehåller denna? Rita den förkortade formeln för molekylen. Svar till frågorna 1. H2N CH COOH R Aminogrupp –NH2 och karboxylsyragrupp –COOH 2. Antingen bildas alanin → valin H2N CH CO CH3 NH CH COOH CH(CH3)2 eller H2N CH Valin → alanin CO CH(CH3)2 NH CH COOH CH3 Reaktionen är en kondensationsreaktion. 3. Aldehydgruppen oxideras till karboxylsyra. Se figur 10.9 (11.9) och 10.11 (11.10) för att se aldehydgruppen. I laborationen Gelfiltrering gjorde ni denna reaktion. 4. Se numreringen i figur 10.9 (11.9) och 10.11 (11.10). Ni behöver inte kunna rita sockermolekylen exakt. 5. Den största molekylen kommer först dvs. proteiner först sedan peptider och sist aminosyror. 6. Peptidkedjorna ligger utsträckta bredvid varandra och bildar flak. Kedjorna binds till varandra med vätebindningar. Se fig 12.14 (12.11) 7. Protein är ett viktigt näringsämne. Fiberproteinerna bildar starka vävnader. De globulära proteinern har många uppgifter i kroppen, se tabell 12.3, enzymer, hormoner, antikroppar och transportproteiner. 8. Alanin är N-terminal och Lysin är C-terminal eftersom de kommer i ordningen Ala-TyrLys. När man ritar peptiden stoppar man in R-grupperna i formeln på sidan 259 (217) i ordning Ala-Tyr-Lys. 9. Ämnesomsättningen är flöden av material och energi i levande celler. Den består av de katabola och anabola reaktionerna. 10. Det bildas aminosyror. Se figur 11.3 (13.3) 11. I glykolysen bryts glukos ner till pyruvatjoner. Detta sker i cellens cytoplasma. 12. ATP är en nukleotid som består av adenosin (adenin + ribos) och tre fosfatgrupper. ATP + H2O→ ADP + fosfat + energi När en bindning bryts frigörs energi och när en ny bindning bildas lagras energi i molekylen. 13. Acetylgruppen finns på sidan 231 (259) och pyruvatjonen på sidan 235 (255). Acetyl CH3-CO- och pyruvat CH3COCOO-. 14. .Aminosyror som har aromatiska ringar eller har grenade sidokedjor. 15. Olika enzymer styr de uppbyggande och nedbrytande reaktionerna. De sker dessutom i olika delar av cellen. De katabola reaktionerna i citronsyracykeln och β-oxidationen sker inne i mitokondrierna medan de anabola reaktionerna sker i cellens cytoplasma. 16. Glykolysen, citronsyracykeln och andningskedjan 17. Kroppen har tre energiförråd, ATP, glykogen och fett. 18. Det bildas acetyl-koenzym A, CH3CO-S-CoA.i båda fallen. Den innehåller två kolatomer (föutom många i koenzymet)Detta är slutprodukten i β- oxidationen samtidigt som fettsyran förkortas med två kolatomer i taget. Pyruvatjonen som bildas i glykolysen spjälkar av koldioxid och omvandlas till acetylgrupper som reagerar med en molekyl koenzym A, (H-S-CoA) och ger acetylkoenzym A.