Normalfloran –stör ej! Tinna (Christina) Åhrén Strama Västra Götaland [email protected] www.vgregion.se/strama Selektionstryck Resistenta bakterier och restensgener anrikas och sprids i närvaro av antibiotika antibiotika bakterie som utvecklat resistens antibiotika Oerhört mycket NY kunskap! • ”Normalflora” ”mikrobiom” (microbiome) • ”Microbiome” • 1000-tals artiklar, majoriteten sedan 2015 • tom nya tidskrifter Hur kunde det explodera såhär? • Ny metodik • Metagenomics • Sekvenseringsmetodik, datatekniskt hantera ”Big Data” • Bakteriefria (germ-free) möss • flera (inter) nationellt finansierade storprojekt • 242 försökspersoner; • Hela humana genomet • Hela bakteriegenomet, 15-18 ställen på kroppen The Human Microbiome Project (HMP) National Institutes of Health (NIH), USA Metagenomics– vi behöver inte odla längre! Metodutvecklingen går supersnabbt! • Vilka bakterier • Substanser bakterierna producerar • Gennivån • Proteinnivå (proteomics) • Substanser ”vi” producerar • Interagerar? van den Elsen LWJ, Clin Transl Immunology (2017) 6, e125 Skepticism kan vara motiverat! Humana mikrobiomet Bakterierna • 100 trillioner • > 1000 arter • 30 % kan odlas fram Taxonomi – E coli Phyla: Proteobacteria Class: gamma-Proteobacteria Order: Enterobacteriales Family: Enterobacteriaceae Genus: Escherichia Specie (Art) : Escherichia coli Subtyper: >1000 st The new tree of life 92 phyla osv LA Hug, Nature microbiology 2016, Mest fokus har lagts på tarmfloran – ”vårt extra organ” Tarmfloran (Gut flora) Bakterierna: • 500 (1000) arter i tarmen • 99% = 30-40 st arter • Obligat anaeroba bakterier dominerar • Två Phyla dominerar • Bacteroidetes • Firmicutis • ”Enterotyper” nja • Stor mellanindividvariation • Relativt stabilt hos var o en kan ändras snabbt Den ”normala” humana florans sammansättning styrs av – allt (?) Ålder Ålder Genetik/Arv Födointag Geografi Säsong Miljö (luftföroreningar) Hygien Hälsotillstånd Immunstatus C. T. Peterson, 2014, Clin exp Immunol 179: 363–377 You name it! Tarmfloran etableras under våra första levnadsår! Hygien Hypotesen ”Rätt” No no Sabrina Tamburini, Nature Medicine 2016: 22, :713–722 Agnes Wold Verkmästaren sitter i magen! Mikrobiom Gerard Clarke, Molecular Endocrinology 28: 1221–1238, 2014 Lokala funktioner i tarmen • Födoämnesmetabolismen (enzym) • bryter ned resistent stärkelse Small chain fatty acids (SCFA) = smörsyra/propionsyra • producerar Vitaminer B o K • absorberar mineraler: Mg/Ca/Fe • Metaboliserar gallan • Håller borta oönskade mikrober/patogener • Bistår immunsystemet tex tolerans mot födoämnen • Bistår lokala nervsystemet (serotonin): peristaltik • Härbärgerar resistenta bakterier/resistensgener Distala funktioner • Immunsystemet • utveckling och forts. funktion • Endokrint organ: metaboliter (SCFA) ~ hormoner • Leverns fettmetabolism • Enteriska nervsystemet • ”gut-brain-axis • HPA-axis” • stress, psyke Gerard Clarke, Molecular Endocrinology 28: 1221–1238, 2014 Många (?) av våra vanliga sjukdomar har kopplingar till mikrobiomet (dysbios) IBS www. nature.com Banbrytande försök (på SU) Mikrobiotan (hos möss) styr • fettmetabolismen (fetma) • typ II diabetsinsjuknande Fredrik Bäckhed, Sahlgrenska Akademien Mikrobiell dysbios • artrikedom minskar • sammansättning av arter förändras Bacteriodetes Firmicutis C. T. Peterson, 2014, Clin Exp Immunol 179: 363–377 ”läckande tarm” och kronisk låggradig inflammation effekter lokalt och på distala organ Hur kan vi påverka floran Shen S, Clin transl Immunology, 2016, 15;5(4):e72 Bakteriekultur • Syrade grönsaker (kimchi) • Youghurt Resistent stärkelse • Potatismjöl • Böner • Baljväxter • Frukt • Grönsaker • Gröna bananer • Korn • Havregryn Polyfenoler • Blåbär • Kryddor • kakao Individanpassad mat (?) Positiva effekter av probiotika Positiva mot IBS Vad blir slutsatsen i nuläget – inget nytt under solen? Hippokrates: ” alla sjukdomar börjar i magen” • Ät en varierad, gärna frukt och grönsaksrik (resistent stärkelse) kost ”prebiotika” • livsmedel med bakteriekulturer (yoghurt/kimchi) ”probiotika” • Undvik • processad mat med tillsatser (emulgeringsmedel, konserveringsmedel etc) • raffinerat socker • stress, överdriven hygien (antibakteriella substanser), sömnbrist • Använd inte antibiotika i onödan • Läs mer: • Youtube, Wikipedia, Populärlitteratur (kost), Vetenskaplig litteratur